Lié aux seigneuries de Lafite et Mouton (futurs Premiers Crus Classés de deux branches distinctes de la famille Rothschild), Château Clerc Milon tient son nom de ses propriétaires historiques, la famille Clerc, qui l’acquiert alors qu’il est vendu comme bien national (1789). En 1850, Clerc associe son nom à celui du hameau de Pauillac voisin, Milon, le château prend alors sa dénomination actuelle.